ViaLinuxis: você e o Linux: bioinformática

19-9-01 - Boletim ViaLinuxis em sintonia com o Fórum

você e o Linux: bioinformática

Editorial

Aqui vai o depoimento do Fábio da USP.

Bom, trabalho com biologia molecular e uso o Linux como plataforma para bioinformática, o Linux mostrou-se uma opção extremamente barata em relação a montar estações mais "dedicadas" (alpha, sun, irix, SGI, etc...) tanto no que se refere ao hardware quanto ao software. A disponibilidade de softwares GPL é muito variada, e muitas vezes utiliza-se o mesmo programa de outras plataformas recompilado para o linux.

Existe muita informação disponível na rede sobre tópicos específicos, tais como sequenciamento, filogenia, códon usage entre outros, e atualmente os novos pacotes de software para bioinformática (mesmo os comerciais) apresentam versão para linux, alem das versões para plataformas mais "fortes", ou seja, é possível utilizar Linux e ter o mesmo poder de fogo de sistemas comerciais.

Na USP, UNICAMP e UNESP a fapesp incentivou diversos laboratórios a lidar com bioinformática (através dos diversos progetos genoma), o que é muito complicado para pessoas que tem a necessidade e não tem dinheiro para contratar especialistas (como eu, pós-graduando...), o que quer dizer que tem muita gente com conhecimento adquirido "na raça" que poderia ser compartilhado, acredito que em outras áreas de interesse dos usuários de Linux aconteça a mesma coisa.

Fabio

Perguntas & Respostas

19-09-01 pdsanches	[1] Tenho um pequeno problema por aqui, gostaria de saber se existe algum software para administração escolar ( Linux ou Ruindows). Somos de uma escola pública e
19-09-01 andres21	Procure o site da Univates www.univates.com.br, eles trabalham no SAGU, que realiza a gestão da Faculdade inteira, é livre, é GPL, estão trabalhando também em
18-09-01 rogeriouep	Prezado André, A distribuição linux instalada no meu PC é o Mandrake 7.1.
18-09-01 utah	[1] Gostaria de perguntar ao Otto se ele pretende tornar esse software Free e torná- lo diponível a toda comunidade ... :}
18-09-01 lightwave	É seria bem legal, aqui uso um monte de farramenta para anlisar a rede, em cada monitor está ocupado todos os terminais, com uma ferramenta dessa o trabalho
18-09-01 supworld	[1] Tenho um servidor linux rodando SAMBA, e tenho um aplicativo que roda em SQL7, o fato é que nao consigo da maquina windows instalar o SQL7 na maquina linux,
18-09-01 lightwave	Na verdade é impossível instalar o SQL Sever no linux (acho que é isso), existe diversos gerenciadores de banco de dados em linux, para mim os melhores estão
17-09-01 di	[1] Diego Duenhas Tenho um servidor de arquivos que roda hoje windows nt 4.0, gostaria que esse servidor se tornasse linux como servidor de arquivos e como DHC
18-09-01 lightwave	Bem, não sou ele mas posso te ajudar nisso: É excelente as configuração da máquina, você terá que instalar dois componentes básicos que terá que funcionar pe
16-09-01 daniel_c15	[1] Oi, tenho o Windows e o Conectiva 5.1 na mesma máquina, é possivel eu instalar mais uma distro em minha máquina?? ps. peso em instalar o Debian. Obrigado
18-09-01 lightwave	Oba!!! Você vai usar Debian!!! Que legal, bem vindo ao clube!!! Olha é possível sim, você só precisar criar um disco para iniciar o debian ou por essa nova e
15-09-01 m.2000	[2] Mais uma!! E tb gostaria de saber se tem como eu fazer um script para que de tempos em tempos, limpe o arquivo de log /var/log/messages automaticamente...Te
18-09-01 lightwave	Bem, a minha é meio porquinha, mas server aos meus propósitos: tenho um script em meu cron que faz só isso: echo > /var/log/messages isso limpa o arquivo
15-09-01 m.2000	[1] Olá galera!! Eu utilizo um script de Firewall para Ipchains que faz máscara da rede interna (NAT) e me gera um log enorme no /var/log/messages....Não pode s
18-09-01 lightwave	Quanto a primeiro questão, que sabe, isso vai depender da análise dos logs. Dá pra filtrar sim, o próprio ipchains faz esse trabalho, acho que o flag para is
13-09-01 marcelo-sa	[4] Como faço para transformar um micro em um roteador com o linux?
18-09-01 lightwave	Oi, o daniloavl pode digitar esses comandos direto no shell, funciona assim, primeiro ele precisa habilitar o forward para fazer com que o linux ou o rotea